Eva Krupičková Pluhařová se věnuje počítačovým simulacím molekul, díky kterým je možné porozumět jejich chování. Dlouhodobě spolupracuje s několika experimentálními skupinami. Se svými studenty se snaží přispět například k pochopení fungování katalyzátoru na přeměnu oxidu uhličitého. To je tématem, které řeší i s kolegy z Nizozemska. Společně se snaží přijít na to, jak omezit tento nechtěný skleníkový plyn nebo ho přeměnit a využít v chemickém průmyslu.
Jak sama uvádí, k chemii se dostala díky chemické olympiádě a nadšenému profesorovi na střední škole. Nominace Evy Krupičkové Pluhařové mezi top vědkyně je tak důkazem, že i regiony, které nemají vědecká centra, vytváří nové talenty.